L'origine du phare de la Pointe de Lighthouse remonte aux années qui suivent la Confédération, lorsque le gouvernement du nouveau Dominion commence à améliorer son système de transport national. À cette époque, les phares étaient construits en bois de façon temporaire. Le premier et le deuxième phare sont construits sur le site de la résidence de John MacNider qui est achetée en 1876.

Le phare de Métis-sur-Mer compte parmi les premières tours en béton armé du Canada. Il est achevé en 1909 par le Département de la Marine et de la Pêche pour les phares. Il appartient aujourd'hui à Transports Canada et est exploité par la Garde côtière canadienne. Maintenant, le phare fonctionne de façon automatique. L'ancienne maison du gardien du phare et les bâtiments secondaires font désormais partie du centre de recherche de Forêts Canada.